5月31日,記者從深圳市疾控中心獲悉,截至5月29日下午14:00,疾控中心病原所新冠溯源團隊已成功獲得“5.21”疫情中穆某等11例境外輸入關聯新冠病毒無癥狀感染者病毒全基因組序列,序列覆蓋度在98.9%-99.9%之間。
經分析,該11例無癥狀感染者的新冠病毒高度同源,均屬于在英國發現的變異株B.1.1.7,推斷穆某等11人屬于同一感染來源或同一傳播鏈。
結合流行病學調查數據,基本判定本起疫情為境外輸入關聯疫情,排除與遼寧、安徽、廣州等國內其他地區近期局部疫情的關聯性。個案12、13的基因測序工作正在進行中。
據了解,B.1.1.7變異株于2020年9月20日被首次報告,并迅速在英國廣泛流行,目前已有130多個國家報道了B.1.1.7變異株。
該變異株包含25個特征性的氨基酸變異位點,其中的N501Y突變可以降低RBD關鍵殘基的極性,從而提高新冠病毒與人體細胞表面ACE2受體的親和力,意味著B.1.1.7變異株具備更強的傳播力。
深圳市疾控中心建立了二代、三代測序平臺。該項技術在傳染病的病原學診斷,發現高變異、罕見以及新病原體方面具有極大優勢,尤其在本次新冠疫情溯源中,發揮著重要的作用。
2021年5月21日下午,市疾控中心新冠病毒溯源團隊接到緊急任務,對鹽田區一例境外輸入關聯新冠無癥狀感染者穆某的樣本進行溯源分析。從樣本準備、文庫構建,上機測序、序列拼接、基因比對、到撰寫溯源分析報告,僅用27小時,大大短于國家標準76小時。
【記者】劉珊
【通訊員】深疾控